Kilisenin Evsiz Çocukları izle, Brezilya'nın kalabalık sokaklarında, kilisenin çevresinde yaşayan birkaç genç günlerini açlıkla, güvensizlikle ve birbirine tutunarak geçirir. Samuel Silva'nın başrolde hayat verdiği gençlerden biri, hayatta kalmak için küçük işlere ve zor kararlara sarılırken, başrolünde Bruno Gagliasso'nun yer aldığı hikayede baskı giderek artar. Hepsi daha iyi bir gelecek kurmaya çalışır, ama bir trajedi kapılarını çaldığında dostlukları ve umutları büyük bir çıkmaza girer.