Şempanze İmparatorluğu izle, Uganda'nın ormanlarında yaşayan geniş bir şempanze topluluğu, yiyecek, alan ve güç için birbirine karşı tetikte bekler. Aile bağları kadar ittifaklar da dengeleri belirlerken, gençler sürü içindeki yerlerini bulmaya çalışır, yetişkinler ise komşu gruplarla gerilimi büyütür. Mahershala Ali'nin seslendirdiği anlatımla ilerleyen bu dünyada her hamle, bir üyenin yaralanmasına, dışlanmasına ya da bütün topluluğun bölünmesine yol açabilecek bir kırılmaya dönüşür.