Waco: Amerikan Kıyameti dizisinde, 1993 baharında Teksas'ın Waco kentinde bir çiftlik evi, silahlı bir topluluğun sığınağına dönüşür ve içeridekilerle dışarıdaki federal güçler arasında giderek sertleşen bir gerilim başlar. David Koresh'in önderliğindeki grup, ellerindeki silahlar ve kapılarını açmayan tutumları yüzünden güvenlik güçlerinin hedefi olur. İçeridekiler teslim olmayı reddederken dışarıda sabır da zaman da tükenmeye başlar.

Üç bölüm boyunca David Thibodeau'nun canlandırdığı genç bir tarikat üyesinin tanıklığıyla, Chris Whitcomb'un hayat verdiği bir FBI görevlisinin bakışıyla ve Bob Ricks gibi isimlerin anlattıklarıyla olayların nasıl kilitlendiği iz sürülerek ortaya çıkarılır. Yerleşkedeki günlük hayat, inançların etrafında kurulan kapalı düzen, çocukların varlığı ve liderin otoritesi çatışmanın ağırlığını daha da artırır. Müzakere girişimleri sürerken taraflar birbirine yaklaşmak yerine daha da sertleşir ve her yeni hamle, geri dönüşü zor bir çizgiyi biraz daha aşar.

Aradan geçen haftalar boyunca kuşatma uzar, medya ilgisi büyür ve ulusal çapta herkes gözünü bu eve çevirir. Kayıtlardan, haber görüntülerinden ve sahadaki insanların anılarından beslenen anlatı, içeride açlıkla, korkuyla ve lidere sadakatle boğuşan insanların dışarıdan gelen baskıya nasıl sıkıştığını gösterir. Alevlerin yükseldiği ana doğru yaklaşılırken herkes ya teslim olup belirsiz bir sonu kabul etmek ya da barikatların içinde kalan son kararını vermek zorunda kalır.